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（3）職能部門和公司分離性機構(gòu)。科研事業(yè)單位在設(shè)立內(nèi)部職能部門，負責成果轉(zhuǎn)化管理職能的同時，設(shè)立獨立全資國有企業(yè)，由企業(yè)開展知識產(chǎn)權(quán)托管、運營、孵化、投資等活動。該類機構(gòu)有利于實現(xiàn)“管辦分離”，強化專業(yè)人才隊伍，但可能因管理人員的不同隸屬關(guān)系不利于協(xié)同推進。

無論采取哪種類型的技術(shù)轉(zhuǎn)移部門建設(shè)方案，科研事業(yè)單位均需要建立內(nèi)部管理制度，對科技成果轉(zhuǎn)化的凈收入，在對完成、轉(zhuǎn)化科技成果做出重要貢獻的人員給予獎勵和報酬后，提取一定比例用于支持本單位科技成果轉(zhuǎn)化專門機構(gòu)的運行發(fā)展以及人員獎勵。

科技成果轉(zhuǎn)化是涉及知識產(chǎn)權(quán)、投資融資、技術(shù)管理、營銷推廣等各領(lǐng)域知識的綜合性活動，科研事業(yè)單位內(nèi)部技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)往往偏重于戰(zhàn)略規(guī)劃、制度建設(shè)、業(yè)務(wù)流程等管理活動。《促進科技成果轉(zhuǎn)化法》規(guī)定，國家設(shè)立的研究開發(fā)機構(gòu)、高等院校可以委托獨立的科技成果轉(zhuǎn)化服務(wù)機構(gòu)開展技術(shù)轉(zhuǎn)移。《國務(wù)院關(guān)于印發(fā)〈國家技術(shù)轉(zhuǎn)移體系建設(shè)方案〉的通知》也提出，鼓勵各類中介機構(gòu)為技術(shù)轉(zhuǎn)移提供知識產(chǎn)權(quán)、法律咨詢、技術(shù)評價等專業(yè)服務(wù)。

對于高校來說，《教育部辦公廳關(guān)于印發(fā)〈促進高等學(xué)校科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化行動計劃〉的通知》提出，整合校內(nèi)各類技術(shù)轉(zhuǎn)移、轉(zhuǎn)化機構(gòu)，促進高校技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)與市場化第三方技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)在信息、人才、孵化空間、技術(shù)轉(zhuǎn)移平臺載體等方面的共享、共建力度，形成集對接市場需求、促進成果交易、投融資服務(wù)等為一體的科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化服務(wù)體系。

因此，科研事業(yè)單位在加強內(nèi)部專業(yè)化技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)建設(shè)的同時，有必要與市場化機構(gòu)建立聯(lián)合關(guān)系，強化知識產(chǎn)權(quán)、投資融資、技術(shù)管理、營銷推廣等方面的服務(wù)能力。

市場化技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)根據(jù)其業(yè)務(wù)范圍確定盈利模式，通常通過為技術(shù)研發(fā)、轉(zhuǎn)讓、許可等技術(shù)轉(zhuǎn)移或成果轉(zhuǎn)化提供咨詢或服務(wù)，或通過載體建設(shè)、服務(wù)換股、孵化投資等活動，收取費用。

（1）開展知識產(chǎn)權(quán)運營、市場行業(yè)分析等，收取服務(wù)費。

（2）幫助科研成果進行中試放大和熟化處理，收取相應(yīng)的服務(wù)費用；

（3）開展項目孵化、科技園區(qū)運作等服務(wù)活動，獲得服務(wù)回報；

（4）通過項目融資，以服務(wù)換股方式在股權(quán)增值變現(xiàn)過程中，獲得服務(wù)回報。

不同的技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)根據(jù)自身的特點和市場定位，可能會采用一種或多種盈利模式的組合。技術(shù)轉(zhuǎn)移機構(gòu)的收費方式也會根據(jù)服務(wù)的性質(zhì)、復(fù)雜度、市場行情以及與客戶的具體協(xié)議來確定。